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Hierarchy of Carbon Source Utilization in Soil Bacteria: Hegemonic Preference for Benzoate in Complex Aromatic Compound Mixtures Degraded by <i>Cupriavidus</i> <i>pinatubonensis</i> Strain JMP134
Indexado
WoS WOS:000354864000002
Scopus SCOPUS_ID:84929857560
DOI 10.1128/AEM.04207-14
Año 2015
Tipo artículo de investigación

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



Cupriavidus pinatubonensis JMP134, like many other environmental bacteria, uses a range of aromatic compounds as carbon sources. Previous reports have shown a preference for benzoate when this bacterium grows on binary mixtures composed of this aromatic compound and 4-hydroxybenzoate or phenol. However, this observation has not been extended to other aromatic mixtures resembling a more archetypal context. We carried out a systematic study on the substrate preference of C. pinatubonensis JMP134 growing on representative aromatic compounds channeled through different catabolic pathways described in aerobic bacteria. Growth tests of nearly the entire set of binary combinations and in mixtures composed of 5 or 6 aromatic components showed that benzoate and phenol were always the preferred and deferred growth substrates, respectively. This pattern was supported by kinetic analyses that showed shorter times to initiate consumption of benzoate in aromatic compound mixtures. Gene expression analysis by real-time reverse transcription-PCR (RT-PCR) showed that, in all mixtures, the repression by benzoate over other catabolic pathways was exerted mainly at the transcriptional level. Additionally, inhibition of benzoate catabolism suggests that its multiple repressive actions are not mediated by a sole mechanism, as suggested by dissimilar requirements of benzoate degradation for effective repression in different aromatic compound mixtures. The hegemonic preference for benzoate over multiple aromatic carbon sources is not explained on the basis of growth rate and/or biomass yield on each single substrate or by obvious chemical or metabolic properties of these aromatic compounds.

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Disciplinas de Investigación



WOS
Biotechnology & Applied Microbiology
Microbiology
Scopus
Sin Disciplinas
SciELO
Sin Disciplinas

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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



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Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 PEREZ-PANTOJA, DANILO RODRIGO Hombre Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile
CSIC - Centro Nacional de Biotecnologia (CNB) - España
2 Leiva-Novoa, Pablo Hombre Universidad Adolfo Ibáñez - Chile
Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile
3 DONOSO-LUNA, RAUL ANDRES Hombre Universidad Adolfo Ibáñez - Chile
Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile
4 Little, Cedric Hombre Universidad Adolfo Ibáñez - Chile
5 Godoy, Margarita Mujer Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile
6 Pieper, Dietmar H. Hombre Helmholtz Ctr Infect Res - Alemania
Helmholtz Centre for Infection Research (HZI) - Alemania
7 GONZALEZ-OJEDA, BERNARDO Hombre Universidad Adolfo Ibáñez - Chile
Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile

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Financiamiento



Fuente
FONDECYT grant
CONICYT Grant
Millennium Nuclei in "Plant Functional Genomics"

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Agradecimientos



Agradecimiento
This study was funded by FONDECYT grant 1110850, CONICYT grant FB 0002-2014, and Millennium Nuclei in "Plant Functional Genomics" grant P10-062F.

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