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High genetic diversity of species A rotaviruses detected in swine farms in Chile
Indexado
WoS WOS:000401905000005
Scopus SCOPUS_ID:85019125289
DOI 10.1099/JGV.0.000662
Año 2017
Tipo artículo de investigación

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



Rotavirus A is one of the main causative agents of diarrhoea in lactating and weaned pigs worldwide. Its impact in the swine industry is well documented. However, in Chile, the current epidemiological status of rotavirus on porcine farms is unknown. This study evaluated the current epidemiologic status of rotavirus A infection in Chile using on-farm detection techniques, electrophoretic confirmation, genotyping and phylogenetic clustering by analysis of partial sequences of VP4 and VP7 genes. Rotavirus A was detected in four out of five farms with an overall prevalence of 17.7% in diarrhoeic pigs. The average age of diarrhoea onset was at 32 +/- 6.2 days, corresponding to weaning pigs, and rotavirus was not detected in lactating piglets. Molecular characterization indicated that genotypes G5, G3, P[7] and P[13] are currently the most widely represented on these pigs farms. The phylogenetic analysis showed that farms shared similar G types (VP7), which might denote a common origin. Meanwhile, [P] types (VP4) showed considerable genetic diversity, and this might represent a high rate of reassortment of this genetic segment in rotavirus circulating in the researched area. These findings demonstrate the importance of considering both the geographical and production factors to accurately determine rotavirus prevalence status at the national level, and have relevant implications in determining effective strategies for rotavirus infection control on porcine farms.

Revista



Revista ISSN
Journal Of General Virology 0022-1317

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Disciplinas de Investigación



WOS
Biotechnology & Applied Microbiology
Virology
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Sin Disciplinas
SciELO
Sin Disciplinas

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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



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Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 Canon-Jones, Hernan Hombre Saponin Res Ctr - Chile
Universidad de Las Américas, Chile - Chile
Saponin Research Center - Chile
Univ Las Amer - Chile
2 Cortes, Hernan Hombre Desert King Chile SA - Chile
Oficina 57 - Chile
3 GAGGERO-BRILLOUET, ALDO ANDRES Hombre Universidad de Chile - Chile
4 LEVICAN-ASENJO, JORGE ENRIQUE Hombre Universidad de Chile - Chile
5 Castillo-Ruiz, Mario Hombre Saponin Res Ctr - Chile
Saponin Research Center - Chile
6 Schlotterbeck, Trinidad Mujer Saponin Res Ctr - Chile
Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile
Saponin Research Center - Chile
7 SAN MARTIN-GAMBOA, RICARDO MANUEL Hombre Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile
7 Martín, Ricardo San Hombre Pontificia Universidad Católica de Chile - Chile

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Financiamiento



Fuente
Fundacion para la Innovacion Agraria from the Ministry of Agriculture, Government of Chile

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Agradecimientos



Agradecimiento
The study was funded by Fundacion para la Innovacion Agraria (project No PYT-2013-0028) from the Ministry of Agriculture, Government of Chile.

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