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Comparative Genomics Points to Ecological Drivers of Genomic Divergence Among Intertidal Limpets
Indexado
WoS WOS:001409885400001
DOI 10.1111/1755-0998.14075
Año 2025
Tipo artículo de investigación

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



Comparative genomic studies of closely related taxa are important for our understanding of the causes of divergence on a changing Earth. This being said, the genomic resources available for marine intertidal molluscs are limited and currently, there are few publicly available high-quality annotated genomes for intertidal species and for molluscs in general. Here we report transcriptome assemblies for six species of Patellogastropoda and genome assemblies and annotations for three of these species (Scurria scurra, Scurria viridula and Scurria zebrina). Comparative analysis using these genomic resources suggest that and recently diverging lineages (10-20 Mya) have experienced similar amounts of contractions and expansions but across different gene families. Furthermore, differences among recently diverged species are reflected in variation in the amount of coding and noncoding material in genomes, such as amount of repetitive elements and lengths of transcripts and introns and exons. Additionally, functional ontologies of species-specific and duplicated genes together with demographic inference support the finding that recent divergence among members of the genus Scurria aligns with their unique ecological characteristics. Overall, the resources presented here will be valuable for future studies of adaptation in molluscs and in intertidal habitats as a whole.

Revista



Revista ISSN
Molecular Ecology Resources 1755-098X

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Disciplinas de Investigación



WOS
Ecology
Biochemistry & Molecular Biology
Evolutionary Biology
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Sin Disciplinas
SciELO
Sin Disciplinas

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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



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Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 Giles, Emily C. - Universidad Austral de Chile - Chile
Cawthron Inst - Nueva Zelanda
2 Gonzalez, Vanessa L. Mujer Smithsonian Inst - Estados Unidos
3 Cariman, Paulina - Universidad Austral de Chile - Chile
4 Leiva, Carlos - Univ Guam Marine Lab - Estados Unidos
5 Suescun, Ana Victoria - Universidad Austral de Chile - Chile
6 Lemer, Sarah - Smithsonian Inst - Estados Unidos
Leibniz Inst Anal Biodivers Change - Alemania
7 Guillemin, Marie Laure - Universidad Austral de Chile - Chile
Centro de Investigacion Dinamica de Ecosistemas Marinos de Altas Latitudes - Chile
Universidad Austral de Chile - Francia
8 Ortiz-Barrientos, Daniel - UNIV QUEENSLAND - Australia
ARC Ctr Excellence Plant Success Nat & Agr - Australia
9 Saenz-Agudelo, Pablo - Universidad Austral de Chile - Chile
Cawthron Inst - Nueva Zelanda
Millennium Nucleus Ecol & Conservat Temperate Meso - Chile

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Financiamiento



Fuente
FONDECYT
BECA CONICYT-PCHA/Doctorado Nacional Chile/2019
National Science Foundation NSF-EPSCoR

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Agradecimientos



Agradecimiento
The work herein presented is supported by the FONDECYT grant No. 1190710 and the scholarship BECA CONICYT-PCHA/Doctorado Nacional Chile/2019 No. 2190878. Part of this work was also supported by the National Science Foundation NSF-EPSCoR Grant No. OIA-1946352. The authors thank members of the Saenz Lab for assistance in the field and processing samples.

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