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The complete mitochondrial genome and microsatellite discovery of the Chilean kelp crab Taliepus dentatus (Brachuyra, Majoidea)
Indexado
WoS WOS:001298612900001
Scopus SCOPUS_ID:85201755969
DOI 10.1163/15685403-BJA10400
Año 2024
Tipo artículo de investigación

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



The complete sequence of the mitochondrial genome and fifteen microsatellite loci for the Chilean kelp crab Taliepus dentatus are reported for the first time. The DNA assembly obtained from an Illumina sequencing revealed a complete mitochondrial genome of 15 603 bp in length. The gene composition and arrangement were similar to that reported for most decapod crabs, containing 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes, two ribosomal RNA genes and a non-coding region. A phylogeny performed with 10 species obtained from GenBank placed T. dentatus close to individuals of the Family Epialtidae. From the 6397 repeated sequences encountered in the data, 15 microsatellite loci primers were designed and five tested for variability in specimens obtained from two sampling sites separated by 300 km of distance. The mean number of alleles per locus was nine (5-15 alleles per locus) and the observed heterozygosities ranged from 0.34 to 0.8. Departure from Hardy-Weinberg equilibrium was observed in two out of the five microsatellites, while none of the loci exhibited significant linkage disequilibrium. This genetic resource will be useful for phylogeny, population genetics and parentage analysis of the commercial species T. dentatus.

Revista



Revista ISSN
Crustaceana 0011-216X

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Disciplinas de Investigación



WOS
Marine & Freshwater Biology
Scopus
Animal Science And Zoology
Aquatic Science
SciELO
Sin Disciplinas

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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



Muestra la distribución de colaboración, tanto nacional como extranjera, generada en esta publicación.


Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 Valenzuela-Carvajal, Pablo - Universidad de Chile - Chile
2 Rojas-Hernandez, N. Mujer Universidad de Chile - Chile
3 VELIZ-BAEZA, DAVID ENRIQUE Hombre Universidad de Chile - Chile
Núcleo Milenio de Ecología y Manejo Sustentable de Islas Oceánicas - Chile
4 Fibla, Pablo Hombre Universidad de Chile - Chile
5 Pardo, Luis Miguel - Universidad Austral de Chile - Chile
Centro de Investigacion Dinamica de Ecosistemas Marinos de Altas Latitudes - Chile

Muestra la afiliación y género (detectado) para los co-autores de la publicación.

Financiamiento



Fuente
ANID Fondecyt
Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo
ANID FONDECYT Postdoctorado
ANID Anillo
FONDAP Dynamics of High Latitude Marine Ecosystems (IDEAL)

Muestra la fuente de financiamiento declarada en la publicación.

Agradecimientos



Agradecimiento
The authors thank I. Garrido for sampling and S. Brito for DNA extraction. This research was financed by ANID FONDECYT 1220179. DV thanks ANID ANILLO ATE220044; LMP thanks research center FONDAP Dynamics of High Latitude Marine Ecosystems (IDEAL), grant No. 15150003; PF thanks ANID FONDECYT Postdoctorado 3220183. The authors dedicate this study to Christoph Schubart who always inspired with his articles and personal discussion of his search for in-depth knowledge in diverse areas of crustacean biology (fig. 4).
The authors thank I. Garrido for sampling and S. Brito for DNA extraction. This research was financed by ANID FONDECYT 1220179. DV thanks ANID ANILLO ATE220044; LMP thanks research center FONDAP Dynamics of High Latitude Marine Ecosystems (IDEAL), grant No. 15150003; PF thanks ANID FONDECYT Postdoctorado 3220183. The authors dedicate this study to Christoph Schubart who always inspired with his articles and personal discussion of his search for in-depth knowledge in diverse areas of crustacean biology (fig. 4).

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