Introducción: Se ha estipulado que los niños con condiciones crónicas de salud, pueden tener un alto riesgo de caries. Aunque la literatura sobre caries tempranas de la infancia (CTI) es extensa, poco se sabe acerca de su prevalencia en niños con estas condiciones. Objetivo: Conocer la prevalencia de CTI en niños con enfermedades respiratorias crónicas (ERC) en el Hospital Calvo Mackenna, Santiago, Chile y determinar su asociación con CTI. Pacientes y Método: Se realizó un estudio de corte transversal, sobre un total de 120 niños de 2 a 5 años 11 meses de edad, un grupo de estudio de 60 niños con ERC y un grupo control de 60 niños sanos fueron analizados. Se diagnosticó CTI de acuerdo a la definición aceptada por la AAPD, mediante un examen oral realizado por un operador bajo condiciones estandarizadas. Para el análisis estadístico se utilizó el programa Stata 11. Resultados: La prevalencia de CTI fue de 53% en niños con ERC y 25% en niños sanos (p < 0,0001). El valor de Qdds Ratio para niños con ERC fue de 7,046 mostrando un incremento del riesgo de CTI, comparado con niños sanos. (95% CI: 2,372-20,929). Conclusión: En esta población, los niños con ERC presentan una alta prevalencia de CTI. En esta muestra se encontró una asociación estadísticamente significativa entre CTI y ERC.