Resumen Introducción: El síndrome de apnea obstructiva del sueño (SAOS) se asocia a aumento de morbimortalidad cardiovascular y metabólica, y a mala calidad de vida. Su diagnóstico y tratamiento eficaz mejora la salud individual y pública. Objetivo: evaluar concordancia entre análisis automático versus manual del dispositivo ApneaLink para diagnosticar y clasificar SAOS en pacientes con sospecha clínica. Material y Método: Evaluación retrospectiva de 301 poligrafías respiratorias del HOSCAR. Se mide correlación, acuerdo general y concordancia entre parámetros obtenidos manual y automáticamente usando coeficiente de Pearson, coeficiente de correlación intraclase y gráfico de Bland y Altman. Resultados: En 11,3% de casos el análisis automático interpreto erróneamente la señal de flujo. No hubo diferencias significativas entre índices de apnea-hipopnea automático (AHIa 18,9 ± 17,5) y manual (AHIm 20,8 ± 19,4) r + 0,97 (95% CI: 0,9571 a 0,9728; p < 0,0001) y tampoco entre la saturación mínima de oxígeno automática (82,1 ± 7,6) y manual (83,1 ± 6,8) r + 0,85 (95% CI: 0,8108 a 0,8766; p < 0,0001). No hubo buena correlación entre análisis automático y manual en clasificación de apneas centrales, r + 0,51 (95% CI: 0,4238 a 0,5942; p < 0,0001). Hubo subestimación de gravedad de SAOS por análisis automático: en 11% de casos. Conclusión: El diagnóstico entregado automáticamente por ApneaLink podría aceptarse sin confirmación manual adicional solamente en casos clasificados como severos. Para AHI menores se requeriría confirmación mediante análisis manual de experto.