Resumen: El objetivo de la investigación fue caracterizar morfológicamente la fruta Physalis peruviana L. (“aguaymanto”) mediante descriptores cualitativos y cuantitativos discriminantes. P. peruviana L. es una de las frutas prometedoras a nivel mundial por sus propiedades nutracéuticas y es importante caracterizarla morfológicamente in situ para conocer la variabilidad existente. Resulta necesario la implementación de bancos de germoplasmas de esta planta ya que el Perú es el centro de origen. Se llevaron a cabo 34 colectas silvestres en las provincias de Huamanga y Huanta del Departamento de Ayacucho (Perú). Como resultado del análisis estadístico, se generan fenogramas para las tres poblaciones Huamanga, Huanta y el total. En el análisis de componentes principales se obtuvo una variación observable total de 44.6%, resultado que evidencia que existe variabilidad. En conclusión, el material recolectado puede ser utilizado en programas de fitomejoramiento genético para el desarrollo tecnológico y económico del país.