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Theoretical Insights on the Inhibition Mechanism of a Class A Serine Hydrolase by Avibactam
Indexado
WoS WOS:000447202800001
Scopus SCOPUS_ID:85054679193
DOI 10.1002/JCC.25340
Año 2018
Tipo artículo de investigación

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



The inhibition mechanism of CTX-M-15 class A serine hydrolase by the inhibitor avibactam is addressed by a combined molecular dynamics (MD) and quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) approach postulating that the residue Ser70 is the sole reacting residue, that is, itself may play the role of the acid-base species required for the enzyme inhibition. Other residues located in the active site have key participation in the positioning of the inhibitor in the right conformation to favor the attack of Ser70, in addition to the stabilization of the transition state by electrostatic interactions with avibactam. The results validate the hypothesis and show that the reaction follows an asynchronous concerted mechanism, in which the nucleophilic attack of the hydroxyl oxygen of Ser70 precedes the protonation of the amidic nitrogen and ring opening. The calculated activation barrier is 16 kcal/mol in agreement with the experimental evidence. (C) 2018 Wiley Periodicals, Inc.

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Disciplinas de Investigación



WOS
Chemistry, Multidisciplinary
Scopus
Chemistry (All)
Computational Mathematics
SciELO
Sin Disciplinas

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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



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Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 LIZANA-BASTIAS, IGNACIO Hombre Universidad de Concepción - Chile
2 DELGADO-RAMIREZ, EDUARDO JOSE LEONARD Hombre Universidad de Concepción - Chile

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Origen de Citas Identificadas



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Citas identificadas: Las citas provienen de documentos incluidos en la base de datos de DATACIENCIA

Citas Identificadas: 33.33 %
Citas No-identificadas: 66.67 %

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Citas identificadas: Las citas provienen de documentos incluidos en la base de datos de DATACIENCIA

Citas Identificadas: 33.33 %
Citas No-identificadas: 66.67 %

Financiamiento



Fuente
FONDECYT
Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico
Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico

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Agradecimientos



Agradecimiento
Fondecyt; Contract grant number: 1170091
Contract grant sponsor: Fondecyt; Contract grant number: 1170091

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