Resumen Introducción: Disfunción del sistema nervioso autonómico ocurre en enfermedades del sistema nervioso central y periférico. Es importante cuantificar el compromiso simpático y parasimpático, diagnosticar la disfunción, monitorizar la evolución y la respuesta a terapias. Las principales pruebas funcionales son las cardiovasculares y sudomotoras. Existen además exámenes para estudiar la disfunción autonómica en distintos órganos y que son específicos de las especialidades médicas respectivas. Desarrollo: Se describen los síntomas, las pruebas funcionales y métodos de estudio a nivel cardiovascular: simpáticas vasomotoras (noradrenérgicas) y cardiovagales (colinérgicas) y las pruebas para la sudoración: sudomotoras simpáticas (colinérgicas). Se describen los síntomas y exámenes a nivel pupilar, urogenital y gastrointestinal. Se señala la utilidad de las pruebas funcionales autonómicas en el estudio de distintas patologías neurológicas. Conclusiones: la evaluación conjunta de los hallazgos clínicos y de las pruebas funcionales autonómicas permiten determinar el nivel anatómico y el grado de severidad de la disfunción autonómica con un fundamento fisiopatológico.