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GeoSP: A parallel method for a cortical surface parcellation based on geodesic distance
Indexado
WoS WOS:000621592202010
DOI
Año 2020
Tipo proceedings paper

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



We present GeoSP, a parallel method that creates a parcellation of the cortical mesh based on a geodesic distance, in order to consider gyri and sulci topology. The method represents the mesh with a graph and performs a K-means clustering in parallel. It has two modes of use, by default, it performs the geodesic cortical parcellation based on the boundaries of the anatomical parcels provided by the Desikan-Killiany atlas. The other mode performs the complete parcellation of the cortex. Results for both modes and with different values for the total number of sub-parcels show homogeneous sub-parcels. Furthermore, the execution time is 82 s for the whole cortex mode and 18 s for the Desikan-Killiany atlas subdivision, for a parcellation into 350 sub-parcels. The proposed method will be available to the community to perform the evaluation of data-driven cortical parcellations. As an example, we compared GeoSP parcellation with Desikan-Killiany and Destrieux atlases in 50 subjects, obtaining more homogeneous parcels for GeoSP and minor differences in structural connectivity reproducibility across subjects.

Disciplinas de Investigación



WOS
Sin Disciplinas
Scopus
Sin Disciplinas
SciELO
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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



Muestra la distribución de colaboración, tanto nacional como extranjera, generada en esta publicación.


Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 Lopez-Lopez, Narciso Hombre Universidad de Concepción - Chile
Univ A Coruna - España
2 Vazquez, Andrea Mujer Universidad de Concepción - Chile
3 Poupon, C. Hombre Paris Saclay Univ - Francia
4 Mangin, Jean-Francois Hombre Paris Saclay Univ - Francia
5 Ladra, Susana Mujer Universidad de Concepción - Chile
Univ A Coruna - España
6 GUEVARA-ALVEZ, PAMELA BEATRIZ Mujer Universidad de Concepción - Chile
7 IEEE Corporación

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Financiamiento



Fuente
European Union
Human Brain Project
ANID Fondecyt
ANID PIA/Anillo de Investigacion en Ciencia y Tecnologia
ANID PFCHA/DOCTORADO NACIONAL
ANID Basal Project

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Agradecimientos



Agradecimiento
This work has received funding by the ANID PFCHA/DOCTORADO NACIONAL/2016-21160342, ANID FONDECYT 1190701, ANID PIA/Anillo de Investigacion en Ciencia y Tecnologia ACT172121, ANID Basal Project FB0008, and by the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Sklodowska-Curie grant agreement No 690941. This work was also partially funded by the Human Brain Project, funded from the European Union's Horizon 2020 Framework Programme for Research and Innovation under the Specific Grant Agreements No. 785907 (SGA2) and No: 604102 (SGA1).

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