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GeoSP: A parallel method for a cortical surface parcellation based on geodesic distance
Indexado
Scopus SCOPUS_ID:85091045373
DOI 10.1109/EMBC44109.2020.9175779
Año 2020
Tipo

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



We present GeoSP, a parallel method that creates a parcellation of the cortical mesh based on a geodesic distance, in order to consider gyri and sulci topology. The method represents the mesh with a graph and performs a K-means clustering in parallel. It has two modes of use, by default, it performs the geodesic cortical parcellation based on the boundaries of the anatomical parcels provided by the Desikan-Killiany atlas. The other mode performs the complete parcellation of the cortex. Results for both modes and with different values for the total number of sub-parcels show homogeneous sub-parcels. Furthermore, the execution time is 82s for the whole cortex mode and 18s for the Desikan-Killiany atlas subdivision, for a parcellation into 350 sub-parcels. The proposed method will be available to the community to perform the evaluation of data-driven cortical parcellations. As an example, we compared GeoSP parcellation with Desikan-Killiany and Destrieux atlases in 50 subjects, obtaining more homogeneous parcels for GeoSP and minor differences in structural connectivity reproducibility across subjects.

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Colaboración Institucional



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Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 Lopez-Lopez, Narciso Hombre Universidad de Concepción - Chile
2 Vazquez, Andrea Mujer Universidad de Concepción - Chile
3 Poupon, C. Hombre Universite Paris-Saclay - Francia
4 Mangin, Jean Francois Hombre Universite Paris-Saclay - Francia
5 Ladra, Susana Mujer Universidad de Concepción - Chile
6 GUEVARA-ALVEZ, PAMELA BEATRIZ Mujer Universidad de Concepción - Chile

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Financiamiento



Fuente
Horizon 2020 Framework Programme

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Agradecimientos



Agradecimiento
Sin Información

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