Resumen: En el presente artículo, se propone una ruta para la generación de compuestos que inhiban el virus del Ébola mediante un estudio de acoplamiento molecular. El anclaje del virus del Ébola se da en la proteína Niemann Pick C1 (NPC1), la cual se encarga del transporte de colesterol en el sistema endosoma/lisosoma. Se aprovecharon moléculas que han sido reportadas experimentalmente como posibles inhibidores del virus, para evaluar una posible inhibición competitiva en estos sistemas moleculares. Se tomaron varias moléculas con energías de afinidad por los sitios activos, lo que permitió identificar el potencial farmacocinético de estas moléculas. Asimismo, se hicieron estudios de adsorción, distribución, metabolismo, y excreción. Se concluye que los resultados expuestos en este trabajo muestran el gran potencial inhibitorio de las moléculas A, B, I, J y K, del anclaje de la glicoproteína del virus del Ébola con la proteína Niemann Pick C1.