Se presenta una metodología que aplica el método de elementos analíticos para el modelado del flujo hídrico subterráneo en acuíferos regionales. El área de estudio es la región ubicada en el Valle del Cariri, parte sur del Estado de Ceará al Noreste de Brasil, que está compuesta por los municipios de Crato, Juazeiro del Norte y Barbalha. La elección de esta región se debe a posee una de las mayores reservas de agua subterránea en roca sedimentaria del Estado de Ceará y también porque el abastecimiento público de las ciudades es realizado casi totalmente con esta agua. Mediante el uso del método analítico y del método numérico, se realiza un estudio comparativo. Se analizan y comparan variables tales como grado de confianza, susceptibilidad, adecuación y exactitud. Se concluye que el modelo analítico posee elevado grado de confianza, no es susceptible a oscilaciones en el modelado, y se mostró adecuado y exacto especialmente cuando es aplicado a acuíferos regionales.