Este artículo analiza las investigaciones antropológicas del pentecostalismo aymara y mapuche en Chile. En concreto, se analizan los presupuestos teóricos presentes en los conceptos de comunidad, sujetos, y su imbricación, presentes en estas investigaciones durante el período 1967-2012. En una primera etapa, los investigadores pioneros destacaron que el crecimiento pentecostal se debía a que el movimiento funcionaba como una comunidad religiosa; en una segunda etapa, el pentecostalismo aymara fue investigado como una secta que intentaba destruir a la sociedad aymara (holocausto). En una tercera etapa, el pentecostalismo mapuche fue concebido como un proceso que implicaba simultáneamente una ruptura y continuidad con la cultura indígena. Por último, los investigadores del pentecostalismo aymara cambiaron su postura holocáustica, preocupándose por los elementos de continuidad-discontinuidad presente en la interacción entre el pentecostalismo y la cultura local.