Introducción: El tratamiento farmacológico con estatinas es eficaz en el control de la hipercolesterolemia Sin embargo, su respuesta terapéutica presenta gran variabilidad interindividual. Factores como edad, género y etnia han sido relacionados a esta variabilidad. Además, estudios recientes demuestran que polimorfismos genéticos también pueden influir sobre la respuesta terapéutica a estos hipolipemiantes. Así, el objetivo del presente trabajo fue investigar el efecto de tres polimorfismos de los genes ABCB1 (3435C>T y 2677G>A>T) y CYP3A4 (-290A>G) sobre la respuesta al tratamiento con atorvastatina en individuos chilenos hipercolesterolémicos. Métodos: Fueron evaluados 94 individuos hipercolesterolémicos adultos, 35 hombres y 59 mujeres, tratados con atorvastatina (10mg/día) durante 4 semanas. Se realizó medición de los niveles séricos de colesterol total, triglicéridos, HDL-c y LDL-c, antes y después del tratamiento. La genotipificación de los polimorfismos se realizó mediante PCR-RFLP Resultados: Después de 4 semanas de tratamiento, se observaron reducciones significativas en los niveles de colesterol total (275 ± 18 vs. 235 ± 22 mg/dL, p<0.001), LDL-c (183 ± 16 vs. 146 ± 24 mg/dL, p<0.001) y triglicéridos (225 ± 48 vs. 172 ± 51 mg/dL, p<0.001). Además, se observó un aumento en las concentraciones de HDL-c (47 ± 10 vs. 55 ± 7, p<0.001). La distribución de genotipos para el polimorfismo 3435C>T (ABCB1) fue: CC=47.9%, CT= 41.5% y TT=10.6%; para el polimorfismo trialélico 2677G>A>T (ABCB1): AA=1.1%, GA=14.9%, GT=28.7%, TA=9.6%, TT=8.5% y GG=37.2% y para -290A>G (CYP3A4) fue: AA= 77.7%, AG= 22.3% y GG=0.0%. Los portadores del alelo G de la variante -290A>G (CYP3A4) presentaron mayor reducción de colesterol total (p=0.001) y LDL-C (p<0.001), y un mayor aumento de HDL-c (p<0.001). No se observaron diferencias significativas para los otros dos polimorfismos estudiados. Conclusión: La respuesta terapéutica a atorvastatina (10mg/día/1mes) es influenciada por la variante -290A>G del gen CYP3A4 en la población estudiada.