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<i>Psychrobacter pygoscelis</i> sp. nov. isolated from the penguin <i>Pygoscelis papua</i>
Indexado
WoS WOS:000514419600031
Scopus SCOPUS_ID:85079020890
DOI 10.1099/IJSEM.0.003739
Año 2020
Tipo artículo de investigación

Citas Totales

Autores Afiliación Chile

Instituciones Chile

% Participación
Internacional

Autores
Afiliación Extranjera

Instituciones
Extranjeras


Abstract



One slightly beige-white pigmented, Gram-stain-negative, rod-shaped bacterium, strain I-STPP5b(T), was isolated from the trachea of a Gentoo penguin chick individual (Pygoscelin papua) investigated in Fildes Bay, Chilean Antarctic (62 degrees 12' S, 58 degrees 57' W). I-STPP5b(T) consists of a 3.4 Mb chromosome with a DNA G+C content of 44.4 mol%. Of the 3056 predicted genes, 1206 were annotated as hypothetical proteins and 51 were tRNAs. Phylogenetic analysis based on nearly full-length 16S rRNA gene sequences showed that the isolate shared a 16S rRNA gene sequence identity to the type strains of Psychrobacter phenylpyruvicus (98.8%), Psychrobacter arenosus and Psychrobacter pasteurii (both 98.3%), Psychrobacter piechaudii (98.2%) and Psychrobacter sanguinis (98.1%), but 16S rRNA gene sequence similarities to all other Psychrobacter species were <= 98.0%. Partial gyrB nucleotide and amino acid sequence similarities among strain STPP5b(T) and the next related type strains were all below 81.8 and 92.9%, respectively. DNA-DNA hybridisation (DDH) with P. phenylpyruvicus LMG 5372(T), P. arenosus DSM 15389(T) and P. sanguinis DSM 23635(T) also showed low values (all below 30%). The main cellular fatty acids of the strain were C-18:1 omega 9c and C-16:1 omega 7c and/or C-16:1 omega 6c. Based on phylogenetic, chemotaxonomic, genomic and phenotypic analyses we propose a new species of the genus Psychrobacter, with the name Psychrobacter pygoscelis sp. nov. and strain I-STPP5b(T) (=CIP 111410(T)=CCM 8799(T)=LMG 30301(T)) as type strain.

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Disciplinas de Investigación



WOS
Microbiology
Scopus
Sin Disciplinas
SciELO
Sin Disciplinas

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Publicaciones WoS (Ediciones: ISSHP, ISTP, AHCI, SSCI, SCI), Scopus, SciELO Chile.

Colaboración Institucional



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Autores - Afiliación



Ord. Autor Género Institución - País
1 Kaempfer, P. Hombre Justus Liebig Univ Giessen - Alemania
Justus Liebig University Giessen - Alemania
Justus-Liebig-Universität Gießen - Alemania
1 Kämpfer, P. Hombre Justus Liebig University Giessen - Alemania
Justus Liebig Univ Giessen - Alemania
Justus-Liebig-Universität Gießen - Alemania
2 Glaeser, Stefanie P. Mujer Justus Liebig Univ Giessen - Alemania
Justus Liebig University Giessen - Alemania
Justus-Liebig-Universität Gießen - Alemania
3 Irgang, Rute Mujer Universidad Nacional Andrés Bello - Chile
Centro Interdisciplinario de Investigación en Acuicultura Sustentable - Chile
4 Fernandez-Negrete, Guillermo Hombre Fraunhofer Chile Res Fdn - Chile
Fraunhofer Chile Research Foundation - Chile
5 Poblete-Morales, Matias Hombre Universidad Nacional Andrés Bello - Chile
Centro Interdisciplinario de Investigación en Acuicultura Sustentable - Chile
6 FUENTES-MESSINA, DERIE ESTEBAN - Fraunhofer Chile Res Fdn - Chile
Fraunhofer Chile Research Foundation - Chile
7 Cortez-San-Martin, Marcelo Hombre Universidad de Santiago de Chile - Chile
8 AVENDANO-HERRERA, RUBEN ESTEBAN Hombre Universidad Nacional Andrés Bello - Chile
Centro Interdisciplinario de Investigación en Acuicultura Sustentable - Chile

Muestra la afiliación y género (detectado) para los co-autores de la publicación.

Financiamiento



Fuente
Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico
Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica
Instituto Antártico Chileno (INACH)
Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica
Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica
Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica
FONDECYT - Comision Nacional de Investigacion Cientifica y Tecnologica (CONICYT, Chile)
FONDAP - Comision Nacional de Investigacion Cientifica y Tecnologica (CONICYT, Chile)
Instituto Antártico Argentino
Institut chilien de l'Antarctique

Muestra la fuente de financiamiento declarada en la publicación.

Agradecimientos



Agradecimiento
RA-H acknowledges support received by the Grants FONDAP No 15110027 and FONDECYT No 1150695, awarded by the Comision Nacional de Investigacion Cientifica y Tecnologica (CONICYT, Chile) and Grant RT_08_13 entitled 'Study of viral and bacterial diversity in seawater and Antarctic fish species: Finding of natural reservoir of salmonid pathogens' by the Instituto Antartico Chileno (INACH).
RA-H acknowledges support received by the Grants FONDAP N° 15110027 and FONDECYT N° 1150695, awarded by the Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica (CONICYT, Chile) and Grant RT_08_13 entitled ‘Study of viral and bacterial diversity in seawater and Antarctic fish species: Finding of natural reservoir of salmonid pathogens’ by the Instituto Antártico Chileno (INACH).

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